소프트웨어
5개의 무료 및 유료 대안을 VMD - Visual Molecular Dynamics에 대한 목록으로 정리했습니다. 주요 경쟁 업체는 pymol, Rasmol입니다. 이 외에도 사용자들은 VMD - Visual Molecular Dynamics와 Jmol, UCSF Chimera, RasTop 간에 비교를 하기도 합니다. 또한 여기서 다른 유사한 옵션을 살펴볼 수 있습니다: About.
PyMOL is a powerful and comprehensive molecular visualization product for rendering and animating...
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VMD는 사용 가능한 메모리 한도까지 매우 큰 구조로 작업 할 수 있습니다. 64 비트 버전의 VMD를 사용하면 대규모 및 장기 규모 시뮬레이션 궤적을 실제 메모리에로드하고 대용량 데이터 세트를 수용 할 수 있습니다. The 64 million atom HIV capsid simulation described in the May 30, 2013 issue of Nature is a first-class example of what can be done with VMD on an appropriately equipped graphics workstation. The HIV-1 model was prepared for simulation using the structure building tools and scripting features of VMD were later used for trajectory analysis. The all-atom structure of the HIV-1 capsid shown on the Nature cover was rendered within VMD using the internal Tachyon ray tracing engine, and was then composited with an artistic representation of the viral envelope and the Nature cover text.
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