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Nós compilamos uma lista de 5 alternativas gratuitas e pagas para o VMD - Visual Molecular Dynamics. Os principais concorrentes incluem: pymol, Jmol. Além disso, os usuários também fazem comparações entre VMD - Visual Molecular Dynamics e Rasmol, RasTop, UCSF Chimera. Além disso, você pode conferir outras opções semelhantes aqui: About.
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PyMOL é um poderoso e abrangente produto de visualização molecular para renderização e animação ...
Jmol é um visualizador de moléculas de código aberto gratuito para estudantes, educadores e pesquisadores em química ...
RasMol é um programa de computador escrito para visualização de gráficos moleculares destinado e ...
O UCSF Chimera é um programa altamente extensível para visualização interativa e análise de ...
VMD é um programa de visualização molecular para exibir, animar e analisar grandes ...
VMD é um programa de visualização molecular para exibir, animar e analisar grandes ...
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O VMD é capaz de trabalhar com estruturas muito grandes até os limites da memória disponível. As versões de 64 bits do VMD permitem que trajetórias de simulação de grande e longo prazo sejam carregadas na memória física e acomodam grandes conjuntos de dados volumétricos. A simulação de capsídeo do HIV de 64 milhões de átomos descrita na edição de 30 de maio de 2013 da Nature é um exemplo de primeira classe do que pode ser feito com o VMD em uma estação de trabalho gráfica adequadamente equipada. O modelo HIV-1 foi preparado para simulação usando as ferramentas de construção da estrutura e os recursos de script do VMD foram posteriormente utilizados para análise de trajetória. A estrutura de todos os átomos do capsídeo do HIV-1 mostrada na capa da Nature foi renderizada no VMD usando o mecanismo de rastreamento de raios Tachyon interno e, em seguida, foi composta com uma representação artística do envelope viral e do texto da capa da Nature.
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